Équipements d'excellence
Plate-formes et plateaux techniques
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Plateforme EQUIPEX REALCAT (École Centrale de Lille)
L’EQUIPEX REALCAT est une plateforme intégrée appliquée au criblage haut débit de CATalyseurs pour les bioraffineries. Cette plate-forme haut débit et unique au monde intègre sur un même lieu la préparation, la caractérisation et la mise en évidence des propriétés catalytiques de nouveaux (bio)catalyseurs, et est consacrée à la catalyse sous toutes ses formes (enzymatique, hétérogène et homogène), ainsi qu’à leurs combinaisons (notion de « catalyse hybride »). À plein potentiel, REALCAT permet de traiter l’ensemble de la chaîne de développement de (bio)catalyseurs jusqu’à leur qualification. La plateforme comprend ainsi des appareillages de synthèse, de caractérisation et d’évaluation des performances catalytiques : 1 Colony Picker, 3 robots de synthèse et de criblage à haut-débit, 2 Biolector pour le criblage de cultures cellulaires, 6 mini-bioréacteurs en parallèle (Vol. utile de 400mL), 1 spectromètre de masse MALDI-Autoflex TOF/TOF, 1 chaine chromatographique liquide (UPLC) couplée à un spectromètre de masse (MS/MS) équipé de la mobilité ionique (ESI-IM-MS/MS) (UPLC-Acquity-Synapt G2Si). Le budget pour l’achat et la maintenance des équipements est de 8,3 millions d’euros. Porteur : UCCS (Unité de Catalyse et Chimie eu Solide) de l’université Lille. L’équipe ProBioGEM est le partenaire majeur pour le développement des approches biotechnologiques.
• 1 BioLector I (M2PLabs) pour le criblage de souches microbiennes et de paramètres fermentaires
• 1 BioLector Pro (M2PLabs) couplé à un Biomek NXp (Beckman Coulter) le criblage avancé de souches microbiennes et de paramètres fermentaires
• 1 Biomek FXp HTS (Beckman Coulter) dédié au criblage à haut débit d’activités enzymatiques
• 1 Biomek FXp BioMol (Beckman Coulter) dédié aux opérations de biologie moléculaire et de microbiologie
• 1 Colony Picker QPix 460 (Molecular Devices) pour le repiquage automatisé de colonies microbiennes
• 1 Spectromètre de masse Q-Tof HRMS Synapt G2Si couplé à une chaine UPLC Aquity (Waters) pour la détection et l’analyse de petites molécules (Substrats/produits, métabolites, peptides et protéines)
• 1 Spectromètre de masse MALDI Autoflex Speed (Bruker) pour la détection et l’analyse de larges molécules (protéines, polymères et micro-organismes)
• 6 Mini fermenteurs de 400mL (Applikon) pour le criblage des conditions de culture microbienne optimales -
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3PB : Plateforme de Production-purification, pilote de biomolécules
La plateforme a pour vocation de mettre à disposition les équipements nécessaires pour la production et la purification des biomolécules. Dans un premier temps les essais en laboratoire permettent de déterminer les fondements scientifiques de la technique (mini fermenteurs, chromatographie, techniques membranaires etc..) permettant la production et la purification des biomolécules (peptides, protéines ou polyphénols). Une fois le protocole expérimental défini la réalisation sur des volumes plus important (mise à l’échelle pilote) est possible. Les essais pilotes ont pour but de régler un certain nombre d'aspects de dimensionnement et d'autres aspects plus techniques. L'expérimentation en pilote est le complément indispensable des essais laboratoires afin de permettre l'utilisation de ces molécules à l’échelle industrielle. Ainsi la plateforme est un élément clef en bioprocedé car elle s'inscrit dans un grand nombre d'activité de l'Institut ainsi que pour ces partenaires industriels.
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BILILLE : plateforme de bioinformatique et bioanalyse de Lille
Bilille organise des journées thématiques, des séminaires techniques et des formations pour permettre à chacun (chercheur, ingénieur ou doctorant) de développer ses compétences en fonction de ses besoins. Il est également de bénéficier du support direct de la plateforme sous la forme de missions ingénieurs. Ces missions sont gérées par un appel à projets annuel. Dans le cadre de l'AAP BILLILE, l'équipe a déjà bénéficié de missions ingénieur en bioanalyses pour explorer des données de structures protéiques pour cribler des enzymes. Valérie LECLERE est membre du bureau et responsable de la cellule communication.
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Plateau technique Bioactivité : développement et exploitation de techniques d’évaluation des activités biologiques de peptides
Salle de culture cellulaire, Animalerie, Lecteur microplaques, Salle radioactive
L’objectif de ce plateau consiste en la mise en place de techniques de dosage mais aussi de méthodologies pour la compréhension des mécanismes d’action des peptides Dans le but de répondre aux besoins des différentes équipes du laboratoire et aux demandes des industriels, le criblage de certaines activités biologiques, en particulier opioïde (implication dans la régulation du stress et de la prise alimentaire), inhibitrice de l’ECA (Enzyme de Conversion de l’Angiotensine) (antihypertensive), régulatrice de la sécrétion des hormones intestinales (CCK/GLP-1 et DPP-IV), est effectué par des dosages in vitro simples et des modèles cellulaires, anti-inflammatoires et anti-oxydantes. Des dosages in vivo sont effectués sur les hydrolysats (ou fractions d’hydrolysats) particulièrement actifs in vitro afin de caractériser et de confirmer l’activité biologique d’intérêt. La cytotoxicité des fractions ou extraits est également évaluée et constitue une expertise forte du plateau technique.
Un lien étroit entre les tests in vitro et les tests in vivo permettra de confirmer les mécanismes biologiques supposés. -
Autres équipements d’excellence
Bioréacteurs
• Minibioréacteur Ambr15
• 3 fermenteurs MiniBio
• Bioréacteurs enzymatiques entièrement régulés
• Fermenteurs 5/10L + pompe péristaltique
• Pompe liquide-solideBiochimie/Biologie moléculaire
• Spectrophotomètre UV/Vis/Fluorimétrie/Luminométrie
• Cytomètres à 2 flux
• Thermocycleurs PCRTraitement des échantillons
• Atomiseur
• Broyeur de cellules
• Ultracentrifugeuse
• Dessiccateur
• Cryostat
• Microplaques Speedvac
• Lyophilisateur
• 3L Rotavapor
• Rotovapor industriel 20LSystèmes analytiques
• Spectromètre de masse HR Qtof
• Système MS Puriflash + TLC-MS
• HPLC DAD - Corona
• Cuve de migration automatisée
• Système automatisé de visualisation TLC
• Système HPTLC Vario
• Chromatographie ionique
• Système CAMAG
• Système d'électro-UltraFiltration
• Système UHPLC - PDA & PDA/QDA
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