Thesis and job offers

Health impact of reactive oxygen species production by mitochondria on the oxidation and quality of seafood products

Characterization of the metabolism and roles of caffeic acid esters in chicory

Exploration of the chemical diversity of wild hops in the Hauts-de-France region under ex-situ conditions by metabolomics and molecular networking for medicinal, brewing and agronomic applications

Study of the potential of agroforestry practices as a support for sustainable agriculture in the Hauts de France Region: characterization of the impact on microbiological dynamics and on the nitrogen use efficiency

Role of dietary proteins in the regulation of intestinal glucose absorption

Hello to all,

The Charles Viollette Institute is offering a new CIFRE thesis in collaboration with an industrialist on "Production of bioactive ingredients by fermentative valorisation of turmeric". The main objectives of the thesis revolve around the valorisation of turmeric root and its derivatives for health nutrition applications and the use of solid and/or liquid fermentation to improve the bioavailability of turmeric metabolites.

This subject is supported by the BIOECOAGRO cross-border joint research unit (UMR) INRAE N°1158, Institut Charles Viollette, Univ Lille, Univ Artois, ULCO, YNCREA. The supervision will be provided by Prof. Vincent Phalip, Dr. François Coutte, Prof. Rozenn Ravallec and Dr. François Krier. Funding will be provided by the industry via a COFRE scheme.

Do not hesitate to download the attached form for more details

Hello,
The UMRt BioEcoAgro is pleased to propose a new thesis topic on "SmartGraze – Improving the pasture management through the precision monitoring of
grazing bites". This thesis will be under the supervision of Prof. SIAH and Dr. BINDELLE.
For more details, please see the attached offer.

Hello,
The UMRt BioEcoAgro is pleased to propose a new thesis topic on the "Development of relevant in vitro or ex vivo methods to study the gut environment and its pathologies". This thesis will be under the supervision of Prof. RAVALLEC and Dr. EVERAERT.
For more details, please see the attached offer.

Hello,
The UMRt BioEcoAgro is pleased to propose a new thesis topic on the "Continuous green extraction of biomolecules from agri-food byproducts". This thesis will be under the supervision of Prof. DIMITROV and Dr. PRADAL.
For more details, please see the attached offer.

Hello,
The UMRt BioEcoAgro is pleased to propose a new thesis topic on "Intensification of lipopeptide production from Pseudomonas sp. in biofilm reactor". This thesis will be under the supervision of Prof. Leclerc and Dr. Lecouturier.
For more details, please see the attached offer.

Hello,
The UMRt BioEcoAgro is pleased to propose a new thesis topic on the "Improvement of plant health by studying the synergistic effects of lipopeptide-producing bacteria
lipopeptide-producing bacteria colonising the rhizosphere". This thesis will be under the supervision of Prof. Leclerc and Dr. Krier.
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Hello,
The UMRt BioEcoAgro is pleased to propose a new thesis topic in "Identification of genes involved in cold response in pea at QTL WFD3.1 and QTL WFD6.1". This thesis will be under the supervision of Prof. Delbreil and Dr. Lejeune.
For more details, please see the attached offer.

Bonjour à tous,

L'Institut Charles Viollette propose un nouveau sujet de thèse sur la "Découverte de nouvelles substances naturelles fongicides par criblage à haut débit de la biodiversité". En partenariat direct avec l'entreprise SOUFFLET, les objectifs principaux de la thèse tourneront autour de la caractérisation des propriétés antifongiques de métabolomes microbiens issus de la biodiversité, notamment à l'aide d'approches à haut débit, selon une approche à l'interface entre la biochimie et la chimie analytique, permettant de découvrir de nouvelles substances naturelles, alternatives possibles aux molécules phytopharmaceutiques issues de l’industrie agrochimique.

Ce sujet est porté par l'UMR-Transfrontalière BIOECOAGRO, Institut Charles VIOLLETTE Université Lille - Polytech Lille. L’encadrement sera assuré par le Pr. Vincent PHALIP (Polytech Lille) et les Dr. Mathieu ALLARD et Dr Loïc LEVAVASSEUR (SOUFFLET). Le financement sera assuré par l'entreprise SOUFFLET.

N'hésitez pas à télécharger la fiche ci-jointe pour plus de détails.

Thématique
Ce projet de thèse s’intègre dans la thématique de l’étude des flores pathogènes, particulièrement en structures aquacoles, développée au sein de l’Unité Biochimie des Produits Aquatiques de l’UMRt INRAe BioEcoAgro à Boulogne sur mer.
Domaine
Dans le cadre de cette thématique, l’intérêt est particulièrement porté sur les bactéries du genre Vibrio responsables d’épisodes de vibriose dans le milieu naturel mais aussi au sein de structures aquacoles (élevage de mollusques, crustacés, poissons). Les travaux de thèse de Julia MOUGIN (2017-2020) ainsi que le projet FEAMP LUVIBAR ont notamment permis la mise en place d’une collaboration avec Aquanord-Ichtus (Gravelines, 59), spécialisé dans l’élevage de bars communs (Dicentrarchus labrax). Cette espèce est particulièrement touchée par la vibriose causée par Vibrio harveyi et entraine des mortalités importantes.
Au cours de ses travaux de thèse, Julia MOUGIN a notamment réalisé une campagne d’échantillonnage, sur plusieurs mois, dans différents compartiments de la structure aquacole (arrivées d’eau alimentant les bassins, eau des bassins, parois des bassins). Cette campagne a permis d’identifier les populations bactériennes présentes et plus spécifiquement les espèces appartenant au genre Vibrio. Ainsi, plus d’un millier d’isolats de Vibrionaceae ont pu être échantillonnés et identifiés par spectrométrie de masse (Mougin et al., (2020a)) et plus spécifiquement, plus de 200 isolats de V. harveyi ont été isolés à partir d’échantillons d’eau et de biofilms.
Objectifs
Ce projet de thèse permettra d’aller plus loin dans la compréhension du développement de la maladie en s’intéressant aux facteurs de virulence et à leur expression dans l’environnement aquacole. La « dangerosité » des souches bactériennes sera également étudiée à travers leurs capacités de persistance sous forme de biofilms mais aussi la présence et l’expression de gènes de résistance aux antibiotiques. L’objectif à terme, et à travers le concept « One Health », est de lutter efficacement contre la vibriose du bar D. labrax tout en développant un système aquacole respectueux de l’environnement et en réduisant l’usage d’antibiotiques afin de réduire les risques pour les poissons élevés mais aussi pour les consommateurs.

Pour plus d’information, veuillez télécharger la fiche de poste associée.

We are looking for a Biology Preparator to fill in for a fixed term contract.

L’Unité Mixte de Recherche Transfrontalière BioEcoAgro (constituée entre autre de l’Institut Charles Viollette, Université de Lille) recrute un(e) technicien(ne) de laboratoire pour son site de Polytech Lille (environ 60 personnes).
Les activités de recherche du site sont centrées sur la microbiologie, la biochimie et les bioprocédés.
Les tâches affectées au poste sont les suivantes :
- Microbiologie et métrologie, reporting des résultats expérimentaux
- Veille au quotidien des bonnes pratiques et de la sécurité au laboratoire
- Accueil des nouveaux arrivants, visite du laboratoire
- Installation des nouveaux appareils et suivi des maintenances
- Surveiller et planifier l’utilisation des appareils et des salles
- Gestions des stocks de petit matériel et de produits chimiques

Pour plus d'information, veuillez consulter la fiche de poste ci-jointe.

Un poste d'ATER en sections 62-64 est à pourvoir pour 2021-2022 à Polytech Lille (Génie des procédés biologiques et alimentaires).
L'enseignement sera réalisé au sein de la spécialité GBA de Polytech Lille, et la recherche au sein de l'UMRT BioEcoAgro. Vous trouverez plus d'information dans la fiche ci-jointe.

Le (la) maître de conférences recruté(e) intégrera l’UMR Transfrontalière BioEcoAgro 1158 sur le site Polytech’Lille. Ses travaux s’inscriront dans le Pôle 2 « Biomolécules d’origine végétale et microbienne : de l’identification à la bioproduction» et plus particulièrement au sein de l’équipe Biotransformation/Enzymes et Biocatalyse. Les activités de recherche porteront sur le développement de procédés séparatifs sélectifs de biomolécules dans un contexte de bioraffinerie en lien avec les autres thématiques du laboratoire. Une priorité sera donnée aux procédés chromatographiques et leur mise en œuvre à grande échelle. Les recherches seront réalisées dans un cadre pluridisciplinaire associant les aspects analytiques (caractérisation et analyses de biomolécules), la réalisation de bancs d’essais expérimentaux (preuve de concept à petite échelle, optimisation) et la transposition à l’échelle pilote.
Une formation doctorale à dominante Génie des Procédés, Biotechnologie, Sciences et Procédés des aliments ou spécialités similaires associée à de bonnes connaissances en biochimie est particulièrement attendue. Le (la) candidat(e) aura par ailleurs montré sa capacité à valoriser les travaux issus de ses recherches antérieures.
Les travaux de recherche du maître de conférences doivent également permettre de renforcer l’axe transversal « Bioprocédés » de l’UMRT BioEcoAgro et l’animation de la recherche dans le cadre du Laboratoire International Associé sur les Antimicrobiens Naturels « LIAAN » entre l’Université de Lille et l’Université Laval (Québec, Canada).

Pour plus d'information, veuillez consulter la fiche de poste ci-jointe.

L'UMR-T BioEcoAgro souhaite se renforcer par un maître de conférences ou une maître de conférencesqui disposera de solides connaissances en chimie du végétal et des interactions entre molécules au sein d'une structure aussi complexe que la matrice végétale, ce qui coïncide avec nos besoins en termes d'enseignements. La personne recrutée pourra s'appuyer sur les connaissances accumulées par l'Unité depuis de nombreuses années sur les chicorées (génome de chicorée, transcriptomes de références, métabolomes etc.)et aura accès à différentes plateformes disponibles sur les différents sites de l'UMR-T. Elle renforcera des collaborations déjà existantes et aura à développer des projets avec de nouveaux acteurs relevant des secteurs publics et/ou privées. Ces compétences sont à l'interface de l'activité de recherche et d'enseignement. De plus, le profil souhaité permettra de créer des collaborations entre les enseignants-chercheurs de l'ILIS et les ceux de l'ICV.

Pour plus d'information, veuillez télécharger la fiche de poste jointe.